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科研进展
鲲鹏院唐中林团队全基因组关联分析鉴定12个与猪生长性状相关新遗传位点
2月27日,佛山鲲鹏现代农业研究院(简称“鲲鹏院”)唐中林团队在Journal of Integrative Agriculture(《农业科学学报》(英文),JIA)上在线发表题为“Genome-wide association study identifies 12 new genetic loci associated with growth traits in pigs”的研究成果,利用全基因组关联分析鉴定12个与猪生长性状相关新遗传位点。
该研究以1186头杜洛克、长白、大白等3个纯种猪为研究对象,利用4种不同统计模型对群体的三个关键生长性状进行全基因组关联分析,共鉴定到5个与背膘厚相关的SNPs,3个与眼肌面积相关的SNPs,6个与达100 kg日龄相关SNPs。此外,结合团队海量转录组数据,发现SKAP2(Src激酶相关磷蛋白2)和PDE7B(磷酸二酯酶7B)在猪骨骼肌生长发育过程中表现出动态表达模式,可能在骨骼肌生长发育中扮演重要角色,是调控猪生长性状的关键基因。总而言之,本研究鉴定到12个新的SNPs位点和6个关键基因,为猪的遗传改良提供了新的基因标记。
图. 应用四种统计模型鉴定与生长性状相关的关键位点
绿色健康养殖研究中心唐中林研究员和杨亚岚博士为共同通讯作者。硕士研究生曾木为本文的第一作者。该研究得到了国家自然科学基金、广东省自然科学基金和中国农业科学院创新工程的资助。