课题组长

唐中林，研究员，博士生导师。中国农业科学院农业基因组研究所首席科学家，动物基因组研究中心主任，2016年入选国家重大人才工程领军人才。2016年在哈佛大学做访问学者。承担国家自然科学基金重点及面上项目、973子课题、863重点和转基因重大专项等国家级课题10余项，在Genome Biology、Nucleic Acid Research、DNA Research等刊物发表SCI论文80余篇，获国家技术发明二等奖、省科技进步奖、中华农业科技奖、国家专利银奖等多项国家及省部级奖，获国家发明专利25项，软件著作权29项，国际发明专利1项。 

研究方向

综合利用高通量的基因组、转录组、代谢组、蛋白组等多种组学技术和精准基因编辑技术，解析猪和小鼠等动物骨骼肌生长发育和重要经济性状形成的分子机制；利用生物信息、分子和细胞生物学等手段，在分子、细胞和个体水平，阐明骨骼肌生长发育相关基因和非编码RNA的功能和表达调控机制。

研究进展

重要进展成果1：公布首个中国地方猪“超清”基因组图谱，提供亚洲地方品种陆川猪参考基因组序列；

重要进展成果2：整合多组学方法和全基因组关联分析鉴定出多个产肉性状密切相关的基因标记；

重要进展成果3：首次建立猪全基因组RNA编辑位点、猪骨骼肌甲基化等多个数据库。

代表性论文

       1. Yalan Yang#, Xinhao Fan#, Junyu Yan#, Muya Chen, Min Zhu, Yijie Tang, Siyuan Liu, Zhonglin Tang*. A comprehensive epigenome atlas reveals DNA methylation regulating skeletal muscle development. Nucleic Acids Research, 2021, 49(3):1313-1329. doi: 10.1093/nar/gkaa1203.

       2. Yalan Yang, Junyu Yan, Xinhao Fan, Jiaxing Chen, Zishuai Wang, Xiaoqin Liu, Guoqiang Yi, Yuwen Liu, Yongchao Niu, Longchao Zhang, Lixian Wang, ShuaiCheng Li, Kui Li*, Zhonglin Tang*. The genome variation and dynamic transcriptome 1 maps in pigs uncover a functional indel of RPS27L influencing muscle growth,PlosGenetics,2021,17(11):e1009910,DOI:10.1371/journal.pgen.1009910

       3. Junyu Yan , Yalan Yang , Xinhao Fan, Guoming Liang , Zishuai Wang, Jiju Li, Liyuan Wang, Yun Chen, Adeyinka Abiola Adetula, Yijie Tang, Kui Li, Dazhi Wang & Zhonglin Tang*(2021) circRNAome profiling reveals circFgfr2 regulates myogenesis and muscle regeneration via a feedback loop,Journal of Cachexia, Sarcopenia and Muscle,DOI:10.1002/jcsm.12859

       4. Adeyinka A. Adetula, Xinhao Fan, Yongsheng Zhang, Yilong Yao, Junyu Yan, Muya Chen, Yijie Tang, Yuwen Liu, Guoqiang Yi, Kui Li & Zhonglin Tang* (2021) Landscape of tissue-specific RNA Editome provides insight into co-regulated and altered gene expression in pigs (Sus-scrofa), RNA Biology, DOI: 10.1080/15476286.2021.1954380

       5. Yalan Yang , Min Zhu, Xinhao Fan, Yilong Yao, Junyu Yan,Yijie Tang, Siyuan Liu, Kui Li* and Zhonglin Tang*. Developmental atlas of the RNA editome in Sus scrofa skeletal muscle. DNA Research, 2019, 26(3):261-272. doi: 10.1093/dnares/dsz006.